1997 থেকে 2000 সাল পর্যন্ত ভারতীয় প্রত্নতত্ত্ব বিভাগের ডক্টর অমরেন্দ্র নাথ রাখিগড়িতে খননকার্যের প্রথম ধাপটি পরিচালনা করেছিলেন যার সময় 2500 খ্রিস্টপূর্বাব্দের উত্তর হরপ্পা সংস্কৃতির প্রমাণ পাওয়া গেছে। রাখি গড়িতে খননের দ্বিতীয় ধাপটি 2006 থেকে 2013 সাল পর্যন্ত পুনের ডেকান কলেজের অধ্যাপক বসন্ত শিন্ডে দ্বারা পরিচালিত হয়েছিল যে সময়ে শিন্দের দল প্রমাণ সংগ্রহ করে এবং ডিএনএ পরীক্ষা পরিচালনা করে যে এই সংস্কৃতি 4,000 বছরেরও বেশি পুরানো হতে পারে। গত দুই বছরে, ASI এবং ডেকান কলেজ পুনে যৌথভাবে ASI যুগ্ম পরিচালক সঞ্জয় কুমার মঞ্জুল এবং ডেকান কলেজ পুনের সহকারী অধ্যাপক প্রবোধ শিরওয়ালকারের নেতৃত্বে একটি দলের মাধ্যমে রাখিগড়িতে খননের তৃতীয় ধাপের কাজ চালিয়েছে।
শিরওয়ালকার বলেন, “হরপ্পা সংস্কৃতির তিনটি অংশ রয়েছে; পূর্ব হরপ্পান, মধ্য হরপ্পান এবং উত্তর হরপ্পান (আধুনিক)। আগের দুটি খননে মধ্য ও আধুনিক হরপ্পা সংস্কৃতির প্রমাণ পাওয়া গেছে যা প্রায় 4,000 বছর আগের। কিন্তু এখন, খননের তৃতীয় ধাপে পাওয়া প্রমাণগুলি দেখায় যে সংস্কৃতিটি 7,000 থেকে 8,000 বছর আগের। কাজের চূড়ান্ত প্রতিবেদন আমাদের দল তৈরি করছে।” শিরওয়ালকার বলেন, এ নিয়ে আরও কয়েক মাস গবেষণা চলবে। “মানুষের 'ডিএনএ' 8,000 বছর ধরে একই রয়ে গেছে যা আমরা আমাদের গবেষণার সময় পেয়েছি। এখানে মানব ফাঁদ পাওয়া গেলে সেগুলো পুঙ্খানুপুঙ্খভাবে পরীক্ষা করা হয়। বিজ্ঞানীরা এর উপর ভিত্তি করে সিদ্ধান্তে এসেছেন। এখানে একটি বড় কবরস্থান পাওয়া গেছে এবং এতে মানুষের ফাঁদের পাশাপাশি পশুর ফাঁদও ছিল,” শিরওয়ালকার বলেন।